科學家開發時空轉錄組學并在亞細胞水平揭示RNA動力學圖譜

日期： 2023年05月12日　14:29 來源：科技部生物中心  　　

細胞轉錄組的時空調節對細胞內蛋白質的正常表達及細胞功能至關重要。然而，由于現有轉錄組學方法不能同時獲得時間和空間數據。美國麻省理工學院研究團隊開發了時空轉錄組測序技術，并應用于探究RNA的生成、轉運和降解速率，在亞細胞水平揭示RNA的動力學圖譜。該研究成果于近日發表在《Nature Methods》上，題為：Spatiotemporally resolved transcriptomics reveals the subcellular RNA kinetic landscape。　　

研究人員利用修飾堿基5-乙炔尿苷建立了一種具有單細胞分辨率且能跨時間和空間獲得RNA概況的轉錄組測序技術（TEMPOmap）。利用該技術，研究人員在亞細胞水平構建了多種人類細胞RNA從轉錄、轉運到降解的動力學圖譜。對單個細胞的RNA動力學參數進行聚類分析，他們提出了“動力學基因簇”。這些基因簇有不同的時間表達特征和亞細胞分布，在功能上也相互獨立，表明不同功能RNA在細胞周期內被動態調控。　　

綜上，研究人員建立的時空轉錄組測序技術可為精準研究RNA時空調控和發現新的基因表達調控機制提供工具。　　

注：此研究成果摘自《Nature Methods》期刊原文章，文章內容不代表本網站觀點和立場，僅供參考。