項目簡介：    野生稻是稻作育種的寶貴遺傳資源，云南是同時擁有全國三種野生稻資源的兩個省份之一。云南野生稻分布廣，生態類型多，蘊藏著十分豐富的優良種質基因。但隨著農業生產發展和人類活動范圍擴大，野生稻自然分布資源處于瀕危狀態。由于多方面的原因云南野生稻資源研究深度和系統性不夠，諸多遺傳特性尚不清，制約了其有效利用。野生稻地下莖性狀決定了野生稻的多年生特性，是一年生水稻向多年生水稻轉化的遺傳基礎，搞清其遺傳規律對于實現稻作育種的重大突破和理論研究具有重要意義。在國家自然科學基金、農業部和云南省資助下，項目組應用現代生物技術與常規技術結合，從云南野生稻資源現狀調查與收集；保存保護體系研究；主要遺傳特性鑒定評價；優異種質基因發掘；長雄野生稻地下莖基因分子定位和相關性狀轉入栽培稻等五個方面開展系統研究。完成了云南野生稻自然分布現狀調查；生長發育特性、主要農藝性狀和遺傳多樣性的系統鑒定；構建了云南野生稻種質資源從DNA分子、細胞、種子到植株（原生境和資源圃）保存保護體系；分離克隆野生稻新抗病基因同源片段和相關重要功能基因40余個；構建了國際上第一張完全基于SSR標記的長雄野生稻分子連鎖圖；獲得了亞洲栽培稻與長雄野生稻種間雜（回）交轉移地下莖性狀的BC2F1群體；定位了長雄野生稻兩對顯性互補的地下莖基因Rhz2(t)和Rhz3(t)和37個地下莖QTLs；開展了水稻與高粱地下莖基因協同進化研究。在《PNAS》、《RGN》、《Plant Science》、《Journal of Integrative Plant Biology》、《中國農業科學》、《作物學報》等刊物和國際國內學術大會上發表研究論文30多篇。研究成果填補了諸多本領域國際國內空白，在珍稀植物資源保存保護、稻作進化、野生稻基因組研究和優異種質基因發掘利用等具有重要科學價值。研究結果被《Critical Reviews in Plant sciences》、《Crop Science》、《Curr Opin Genet Dev》等引用，被SCI、PubMed、NCBI GenBank、http://www.gramene.org等收錄。

主要發現點：  1、構建了國際上第一張完全基于SSR標記的長雄野生稻分子連鎖圖，并在國際上首次發表，被http://www.gramene.org收錄。所屬學科為農業植物學。

2、通過亞洲栽培稻（O.sativa）與長雄野生稻（O.longistaminata）種間雜（回）交，獲得了地下莖的種間雜（回）交轉移的BC2F1群體，并首先在國際上發表。見論文[5]，所屬學科為農業植物學。

3、定位了長雄野生稻兩對顯性互補的地下莖基因Rhz2（t）和Rhz3（t）和37個地下莖QTLS。見論文[1]和[6]，所屬學科為農業植物學。

4、通過水稻與高粱地下莖基因遺傳圖譜的比較分析，在國內外首次報道：Rhz3（t）同控制野生高粱（Sorghum propinquum）地下莖表達位于D組csu4和pSB188之間的主效QTL相對應；而Rhz2（t）高粱C組上的三個緊密連鎖QTLS相對應。表明Rhz2（t）、Rhz3（t）可能是禾本科地下莖的重要調節基因。見論文[1]，所屬學科為農業植物學。

5、對云南野生稻自然分布現狀、病蟲害，原生境伴生植物進行了全面考察，摸清了云南野生稻資源分布現狀，運用GPS等技術建立了云南野生稻GPS/GIS信息數據庫。新發現疣粒野生稻分布點15個、藥用野生稻分布點2個、普通野生稻分布點1個，在云南野生稻處于瀕危狀況下新發現的這些野生稻自然分布居群，對豐富野生稻遺傳資源具有重要意義。見論文[9]和[10]，所屬學科為農業植物學。

6、集成運用生物技術與常規技術，構建了云南野生稻種質資源從DNA分子、細胞、種子到植株（原生境和資源圃）保存保護體系。其中普通和疣粒野生稻BAC文庫構建和保存研究，先于美國AGI。見論文[9]，所屬學科為農業植物學。

7、完成了云南三種野生稻生長發育特性、主要農藝性狀和遺傳多樣性的系統鑒定評價；發現云南野生稻綜合品質高于栽培稻。其中氨基酸和10種礦質元素含量是首次報道；發現除Ca、Fe、Mn等以外的其它野生稻米營養成分主要受遺傳控制，云南野生稻居群間遺傳多樣性遠高于居群內。見論文[3] 、[4]和[7]，所屬學科為農業植物學。

8、在GenBank上注冊登記野生稻新抗病基因同源片段或cDNA30個；首次構建了三種野生稻全長cDNA文庫5個，并從中分離了一批重要功能基因；從云南普通野生稻中分離抗稻瘟病Pi-ta-和Pi-ta+基因各1個、抗白葉枯病Xa21基因4個、抗病相關基因片段多個，并開展了這些基因結構與功能的研究，從比較基因組學角度探討了這些基因在不同野生稻之間的分子進化。在野生稻基因組學研究方面填補了諸多國際空白。見論文[2]和[7]，所屬學科為農業植物學。

主要完成人：  1.   黃興奇

研究方案設計，研究工作的指導和分析總結，論文審查修改。參與野生稻資源考察，野生稻系統鑒定評價，基因分析研究。主要貢獻在發現點5-8，見論文2、3、4、7。在項目中的工作量占本人工作量的55%。

2.   陶大云

長雄野生稻分子圖譜的構建，地下莖遺傳分析，與栽培稻雜交后代群體的建立和選擇。長雄野生稻地下莖基因與野生高粱的協同進化分析。主要貢獻在發現點1-4。在項目中的工作量占本人工作量的60%。

3.   戴陸園

主持完成云南野生稻種質資源的考察調查、云南野生稻伴生植物調查和分析、云南三種野生稻原位保護點建設；發現了新野生稻分布點,為原生境有效保護積累了基礎資料;率先提出在保護中"植物籬笆"的設想并組織實施。主要貢獻在發現點5和6。在項目中的工作量占本人工作量的55%。

4.   胡鳳益

地下莖基因分子定位及分子連鎖圖建立，雜交后代群體的構建。主要貢獻在發現點2和3。在項目中的工作量占本人工作量的70%。

5.   程在全

在項目的實施過程中，協助主持人工作，參加野生稻遺傳特性的鑒定研究，構建基因文庫和基因的分離分析，撰寫研究論文。主要貢獻在發現點6-8。在項目中的工作量占本人工作量的70%。

10篇代表性論文：  1.   10篇論著1：Convergent evolution of perenniality in rice and sorghum. Proc.

2.   10篇論著2：Nucleotide Sequence of a Resistance Gene Homologue from Oryza Officinals Wall.

3.   10篇論著3：Genetic diversity among and within populations of Oryza granulata from Yunnan of China revealed by RAPD and ISSR markers: implications for conservation of the endangered species

4.   10篇論著4：Diversity in the Content of Some Nutritional Components in Husked Seeds of Three Wild Rice Species and Rice Varieties in Yunnan Province of China

5.   10篇論著5：Rhizomatous individual was obtained from interspecific BC2F1 progenies between Oryza sativa and Oryza longistaminata. RGN, 18:11-13

6.   10篇論著6：TI-139

7.   10篇論著7：云南3種野生稻中抗病基因同源序列的克隆及序列分析

8.   10篇著作8：云南野生稻對稻瘟病的抗性評價

9.   10篇著作9：云南野生稻資源考察及分布現狀分析

10.  10篇著作10：云南三種野生稻原生境植物種群的調查及比較分析